文献解读
天然产物改造显威力!!!!Adv Sci:小檗碱衍生物B68双靶BMI1/CSN5,,,为肿瘤免疫治疗提供新候选
在癌症治疗领域,,,寻找高效且低副作用的治疗策略始终是科研人员不懈努力的方向。。。小檗碱,,,作为一种从植物中提取的天然生物碱,,近年来因其广泛的药理活性备受关注,,尤其是在抗癌方面展现出巨大潜力。。。。今天和大家分享一篇关于聚焦小檗碱衍生物B68在肿瘤治疗领域探索的文章,,该文章于2024年12月发表在Advanced Science杂志上,,标题为“Berberine Derivative B68 Promotes Tumor Immune Clearance by Dual‐Targeting BMI1 for Senescence Induction and CSN5 for PD‐L1 Degradation”。。
01. 研究思路
该研究围绕“解决肿瘤衰老诱导与免疫逃逸矛盾”展开,,以技术为核心驱动力推进探索:先通过小檗碱母核结构修饰,,,结合CCK-8、、、、集落形成实验筛选出高抑瘤活性(RKO 细胞 IC50 1.03 μm)且低毒的衍生物B68;细胞机制解析阶段,,用转录组加蛋白质组测序锁定“细胞周期”“p53信号通路”,,,,借 DARTS、、、pull-down结合proteomics交叉分析筛选BMI1、、CSN5靶点,,再经CETSA、、、、MST及分子对接验证B68与BMI1(Arg123 位点,,,Kd=91.4 nm)、、、CSN5(Glu76 位点)直接结合,,通过基因敲除、、、、CHX/MG132干预实验明确其诱导细胞衰老及降解PD-L1的机制;体内验证环节,,,构建裸鼠移植瘤、、AOM/DSS化学诱导结直肠癌、、、、免疫正常小鼠MC38移植瘤模型,,,用SA-β-gal染色、、、IHC、、WB证实抑瘤效果,,,流式细胞术分析免疫细胞浸润验证免疫激活及与抗CTLA4协同增效,,,结合DC细胞成熟标志物检测探索免疫原性;最后通过人类结直肠癌组织WB、、、、免疫荧光检测及TCGA/TIMER 2.0数据库生存与相关性分析,,,,佐证靶点临床价值,,,,全程以多元技术层层递进验证B68双靶向抗癌机制,,为相关肿瘤治疗及B68临床前研究奠定基础。。
02. 主要研究内容
(1)B68通过靶向BMI1诱导结直肠癌细胞衰老
为探究B68诱导结直肠癌细胞衰老的分子机制,,先对B68处理的RKO细胞做转录组测序:KEGG 分析显示“细胞周期”“p53信号通路”“细胞衰老通路”为Top3富集通路(匹配衰老表型),,GO分析进一步证实衰老通路激活;B68处理组1050个基因mRNA上调、、、1221个下调,,其中CXCL8、、、TP53等衰老相关基因上调,,,CCNA2、、、FOXM1等下调。。。同步开展的蛋白质组分析也显示这三条通路最富集,,,,且CCND3、、、RBL2等衰老相关蛋白表达显著变化,,,,共同确认B68通过调控衰老通路起效。。。。筛选靶点时,,,DARTS技术预测33个潜在结合蛋白(unique peptide≥2,,,,强度比≥1.5);合成生物素标记B68(Bio-B68,,,可诱导RKO衰老),,,,经pull-down结合质谱获得15个靶点。。。。整合多组学结果得4个候选基因,,,基因干扰实验仅敲低BMI1诱导衰老,,,确定其为核心靶点。。在验证阶段:免疫印迹显示B68以时间/浓度依赖性降RKO、、HCT116细胞BMI1蛋白(不影响mRNA),,提示降解机制;敲除BMI1后,,,细胞经SA-β-gal染色、、、p53/p21检测、、、H3K9me3免疫荧光均显衰老,,且B68无法再诱导衰老,,证实B68依赖BMI1诱导衰老。。。
(2)BMI1的Arg123位点对结合B68至关重要
用细胞热转移实验CETSA证实B68在37-83℃增强BMI1热稳定性,,,,65℃及酶-裂解液1:300条件下均观察到BMI1积累随B68浓度升高而增加,,,佐证二者直接结合;再经Maestro软件(Schrödinger 9.0)分子对接模拟、、、、MST检测(Kd=91.4 nm),,,,发现BMI1的Glu120和Arg123与B68形成氢键,,,细胞MST实验显示Arg123突变完全阻断复合物形成,,证实其为关键结合位点;此外,,免疫印迹显示 B68以时间/浓度依赖性降低BMI1蛋白(不影响mRNA),,敲除BMI1后细胞显衰老且B68无法再诱导,,,最终证实B68依赖结合BMI1的Arg123位点,,,,诱导结直肠癌细胞衰老。。。
(3)B68通过靶向CSN5介导PD-L1降解
鉴于小檗碱可通过调控PD-L1表达发挥抗肿瘤免疫作用,,,研究人员对化合物B68展开探究,,通过WB、、流式细胞术、、免疫荧光实验验证B68能以剂量依赖性方式降低结直肠癌细胞系(RKO 和 HCT116)中PD-L1的表达,,,,进而减少癌细胞与PD-1的结合能力,,,,且在与T细胞共培养实验中可剂量依赖性降低上述癌细胞活性,,,,表明其能通过下调PD-L1发挥抗肿瘤免疫作用;机制研究发现,,,B68不影响PD-L1 的转录水平(PD-L1 mRNA 无变化),,,,而是通过翻译后修饰调控其表达,,具体为依赖泛素-蛋白酶体途径(蛋白酶体抑制剂MG132可逆转B68诱导的PD-L1降解,,,,自噬抑制剂则无此效果,,,,且B68可增加 PD-L1泛素化水平);分子对接、、、微量热泳动(MST)及免疫沉淀(IP)实验进一步证实,,B68通过靶向CSN5蛋白的Glu76位点,,,结合CSN5与PD-L1的相互作用,,,,最终介导PD-L1的泛素化降解。。。。
03. 参考文献
Hu H, Wang Q, Yu D, et al. Berberine Derivative B68 Promotes Tumor Immune Clearance by Dual‐Targeting BMI1 for Senescence Induction and CSN5 for PD‐L1 Degradation. Advanced Science. 2024,12(7):2413122. doi: